Protein–RNA interactions for Protein: P53849

GIS2, Zinc finger protein GIS2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GIS2P53849 VPS54YDR027C 2670 nt1.98□□□□□ -2.09
GIS2P53849 SNU114YKL173W 3027 nt1.97□□□□□ -2.09
GIS2P53849 GUP1YGL084C 1683 nt1.97□□□□□ -2.09 RIP-Chip
GIS2P53849 MUK1YPL070W 1839 nt1.97□□□□□ -2.09
GIS2P53849 RPS17BYDR447C 411 nt1.97□□□□□ -2.09 RIP-Chip
GIS2P53849 ULI1YFR026C 510 nt1.97□□□□□ -2.09
GIS2P53849 RPS28BYLR264W 204 nt1.97□□□□□ -2.09
GIS2P53849 RSM19YNR037C 276 nt1.97□□□□□ -2.09
GIS2P53849 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt1.97□□□□□ -2.09
GIS2P53849 FAS1YKL182W 6156 nt1.97□□□□□ -2.09
GIS2P53849 HEH2YDR458C 1992 nt1.97□□□□□ -2.09
GIS2P53849 UBP1YDL122W 2430 nt1.97□□□□□ -2.09
GIS2P53849 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt1.97□□□□□ -2.09
GIS2P53849 ATG13YPR185W 2217 nt1.97□□□□□ -2.09
GIS2P53849 STE11YLR362W 2154 nt1.96□□□□□ -2.1
GIS2P53849 MDM1YML104C 3384 nt1.96□□□□□ -2.1 RIP-Chip
GIS2P53849 YDR286CYDR286C 345 nt1.96□□□□□ -2.1
GIS2P53849 YGL069CYGL069C 465 nt1.96□□□□□ -2.1
GIS2P53849 TRX1YLR043C 312 nt1.96□□□□□ -2.1
GIS2P53849 FPR1YNL135C 345 nt1.96□□□□□ -2.1
GIS2P53849 SGF11YPL047W 300 nt1.96□□□□□ -2.1 RIP-Chip
GIS2P53849 RPS23BYPR132W 438 nt1.96□□□□□ -2.1 RIP-Chip
GIS2P53849 IPT1YDR072C 1584 nt1.96□□□□□ -2.1
GIS2P53849 ITC1YGL133W 3795 nt1.96□□□□□ -2.1
GIS2P53849 YOR296WYOR296W 3870 nt1.95□□□□□ -2.1
GIS2P53849 DFG16YOR030W 1860 nt1.95□□□□□ -2.1
GIS2P53849 YCG1YDR325W 3108 nt1.95□□□□□ -2.1
GIS2P53849 PMP1YCR024C-A 123 nt1.95□□□□□ -2.1
GIS2P53849 snR72snR72 98 nt1.95□□□□□ -2.1
GIS2P53849 YEL073CYEL073C 324 nt1.95□□□□□ -2.1
GIS2P53849 HSC82YMR186W 2118 nt1.95□□□□□ -2.1
GIS2P53849 YOL057WYOL057W 2136 nt1.95□□□□□ -2.1
GIS2P53849 SPB1YCL054W 2526 nt1.95□□□□□ -2.1 RIP-Chip
GIS2P53849 KAR3YPR141C 2190 nt1.95□□□□□ -2.1
GIS2P53849 SPT21YMR179W 2277 nt1.94□□□□□ -2.1
GIS2P53849 TFC4YGR047C 3078 nt1.94□□□□□ -2.1
GIS2P53849 CDC20YGL116W 1833 nt1.94□□□□□ -2.1
GIS2P53849 SNQ2YDR011W 4506 nt1.94□□□□□ -2.1
GIS2P53849 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.94□□□□□ -2.1 RIP-Chip
GIS2P53849 YGL024WYGL024W 336 nt1.94□□□□□ -2.1
GIS2P53849 snR43snR43 209 nt1.94□□□□□ -2.1
GIS2P53849 BNI4YNL233W 2679 nt1.94□□□□□ -2.1
GIS2P53849 TMN3YER113C 2121 nt1.93□□□□□ -2.1
GIS2P53849 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt1.93□□□□□ -2.1
GIS2P53849 RPL6AYML073C 531 nt1.93□□□□□ -2.1
GIS2P53849 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt1.93□□□□□ -2.1
GIS2P53849 COG3YER157W 2406 nt1.93□□□□□ -2.1
GIS2P53849 RCY1YJL204C 2523 nt1.93□□□□□ -2.1
GIS2P53849 DOT6YER088C 2013 nt1.93□□□□□ -2.1
GIS2P53849 PDR3YBL005W 2931 nt1.93□□□□□ -2.1
GIS2P53849 SLN1YIL147C 3663 nt1.93□□□□□ -2.1
GIS2P53849 TAO3YIL129C 7131 nt1.93□□□□□ -2.1
GIS2P53849 TSC11YER093C 4293 nt1.92□□□□□ -2.1
GIS2P53849 PMP2YEL017C-A 132 nt1.92□□□□□ -2.1
GIS2P53849 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt1.92□□□□□ -2.1
GIS2P53849 YBL065WYBL065W 345 nt1.92□□□□□ -2.1
GIS2P53849 NOP53YPL146C 1368 nt1.92□□□□□ -2.1 RIP-Chip
GIS2P53849 FKS3YMR306W 5358 nt1.92□□□□□ -2.1
GIS2P53849 ROM1YGR070W 3468 nt1.92□□□□□ -2.1
GIS2P53849 SPO21YOL091W 1830 nt1.91□□□□□ -2.1
GIS2P53849 ESL1YIL151C 3357 nt1.91□□□□□ -2.1
GIS2P53849 CFT2YLR115W 2580 nt1.91□□□□□ -2.1
GIS2P53849 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt1.91□□□□□ -2.1
GIS2P53849 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt1.91□□□□□ -2.1
GIS2P53849 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt1.91□□□□□ -2.1
GIS2P53849 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt1.91□□□□□ -2.1
GIS2P53849 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt1.91□□□□□ -2.1
GIS2P53849 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt1.91□□□□□ -2.1
GIS2P53849 RAM2YKL019W 951 nt1.91□□□□□ -2.1
GIS2P53849 RPS17AYML024W 411 nt1.91□□□□□ -2.1
GIS2P53849 RPL33BYOR234C 324 nt1.91□□□□□ -2.1
GIS2P53849 GIS4YML006C 2325 nt1.91□□□□□ -2.1
GIS2P53849 ALK2YBL009W 2031 nt1.91□□□□□ -2.1
GIS2P53849 ASG1YIL130W 2895 nt1.91□□□□□ -2.1
GIS2P53849 CCM1YGR150C 2595 nt1.91□□□□□ -2.1
GIS2P53849 GIN4YDR507C 3429 nt1.91□□□□□ -2.1
GIS2P53849 HFM1YGL251C 3564 nt1.9□□□□□ -2.1
GIS2P53849 PLC1YPL268W 2610 nt1.9□□□□□ -2.1
GIS2P53849 YGR067CYGR067C 2415 nt1.9□□□□□ -2.1
GIS2P53849 SPO71YDR104C 3738 nt1.9□□□□□ -2.1
GIS2P53849 ECM12YHR021W-A 456 nt1.9□□□□□ -2.11
GIS2P53849 RPL25YOL127W 429 nt1.9□□□□□ -2.11
GIS2P53849 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt1.9□□□□□ -2.11
GIS2P53849 CHS3YBR023C 3498 nt1.9□□□□□ -2.11
GIS2P53849 YIL169CYIL169C 2988 nt1.89□□□□□ -2.11 RIP-Chip
GIS2P53849 MSH2YOL090W 2895 nt1.89□□□□□ -2.11
GIS2P53849 YOR333CYOR333C 417 nt1.89□□□□□ -2.11
GIS2P53849 YEL043WYEL043W 2871 nt1.89□□□□□ -2.11
GIS2P53849 TOR1YJR066W 7413 nt1.89□□□□□ -2.11
GIS2P53849 PAN3YKL025C 2040 nt1.89□□□□□ -2.11
GIS2P53849 TOP1YOL006C 2310 nt1.89□□□□□ -2.11
GIS2P53849 SET1YHR119W 3243 nt1.89□□□□□ -2.11
GIS2P53849 SEC15YGL233W 2733 nt1.89□□□□□ -2.11
GIS2P53849 DBP7YKR024C 2229 nt1.89□□□□□ -2.11
GIS2P53849 YDR186CYDR186C 2634 nt1.88□□□□□ -2.11
GIS2P53849 BAS1YKR099W 2436 nt1.88□□□□□ -2.11
GIS2P53849 TFC8YPL007C 1767 nt1.88□□□□□ -2.11
GIS2P53849 ILS1YBL076C 3219 nt1.88□□□□□ -2.11
GIS2P53849 ECM21YBL101C 3354 nt1.88□□□□□ -2.11
GIS2P53849 PIG1YLR273C 1947 nt1.88□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.6 ms