Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DAP3P51398 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DAP3P51398 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DAP3P51398 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DAP3P51398 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DAP3P51398 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DAP3P51398 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DAP3P51398 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DAP3P51398 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DAP3P51398 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DAP3P51398 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DAP3P51398 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DAP3P51398 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DAP3P51398 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DAP3P51398 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DAP3P51398 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DAP3P51398 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DAP3P51398 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DAP3P51398 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DAP3P51398 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DAP3P51398 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DAP3P51398 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DAP3P51398 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DAP3P51398 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DAP3P51398 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DAP3P51398 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DAP3P51398 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DAP3P51398 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DAP3P51398 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DAP3P51398 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DAP3P51398 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DAP3P51398 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DAP3P51398 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DAP3P51398 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DAP3P51398 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DAP3P51398 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DAP3P51398 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DAP3P51398 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DAP3P51398 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DAP3P51398 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DAP3P51398 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DAP3P51398 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DAP3P51398 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DAP3P51398 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DAP3P51398 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DAP3P51398 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DAP3P51398 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DAP3P51398 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DAP3P51398 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DAP3P51398 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DAP3P51398 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DAP3P51398 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DAP3P51398 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DAP3P51398 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DAP3P51398 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DAP3P51398 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DAP3P51398 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DAP3P51398 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DAP3P51398 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DAP3P51398 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DAP3P51398 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DAP3P51398 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DAP3P51398 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DAP3P51398 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DAP3P51398 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DAP3P51398 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DAP3P51398 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DAP3P51398 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DAP3P51398 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DAP3P51398 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DAP3P51398 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms