Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK1EP49674 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms