Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK8P49336 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK8P49336 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK8P49336 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK8P49336 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK8P49336 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK8P49336 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK8P49336 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK8P49336 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK8P49336 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK8P49336 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK8P49336 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK8P49336 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK8P49336 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK8P49336 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK8P49336 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK8P49336 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK8P49336 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK8P49336 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK8P49336 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK8P49336 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK8P49336 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK8P49336 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK8P49336 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK8P49336 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK8P49336 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK8P49336 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK8P49336 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK8P49336 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK8P49336 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK8P49336 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK8P49336 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK8P49336 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK8P49336 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK8P49336 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK8P49336 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK8P49336 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK8P49336 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK8P49336 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK8P49336 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK8P49336 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK8P49336 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK8P49336 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK8P49336 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK8P49336 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK8P49336 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK8P49336 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK8P49336 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK8P49336 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK8P49336 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK8P49336 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK8P49336 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK8P49336 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK8P49336 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK8P49336 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK8P49336 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK8P49336 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK8P49336 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK8P49336 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK8P49336 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK8P49336 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK8P49336 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK8P49336 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK8P49336 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK8P49336 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK8P49336 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK8P49336 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK8P49336 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK8P49336 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK8P49336 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK8P49336 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDK8P49336 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDK8P49336 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDK8P49336 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK8P49336 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK8P49336 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK8P49336 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK8P49336 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK8P49336 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK8P49336 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK8P49336 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK8P49336 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK8P49336 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK8P49336 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK8P49336 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK8P49336 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK8P49336 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK8P49336 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK8P49336 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK8P49336 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK8P49336 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK8P49336 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK8P49336 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK8P49336 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK8P49336 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK8P49336 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK8P49336 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK8P49336 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK8P49336 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK8P49336 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms