Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms