Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP1P32455 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP1P32455 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP1P32455 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP1P32455 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP1P32455 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP1P32455 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP1P32455 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP1P32455 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP1P32455 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP1P32455 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP1P32455 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP1P32455 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP1P32455 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP1P32455 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP1P32455 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP1P32455 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP1P32455 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP1P32455 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP1P32455 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP1P32455 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP1P32455 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP1P32455 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP1P32455 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP1P32455 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP1P32455 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP1P32455 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP1P32455 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP1P32455 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP1P32455 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP1P32455 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP1P32455 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP1P32455 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP1P32455 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP1P32455 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP1P32455 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP1P32455 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP1P32455 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP1P32455 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP1P32455 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP1P32455 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP1P32455 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP1P32455 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP1P32455 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP1P32455 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP1P32455 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP1P32455 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP1P32455 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP1P32455 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP1P32455 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP1P32455 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP1P32455 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBP1P32455 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBP1P32455 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBP1P32455 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBP1P32455 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBP1P32455 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBP1P32455 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP1P32455 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP1P32455 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP1P32455 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP1P32455 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP1P32455 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP1P32455 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP1P32455 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP1P32455 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP1P32455 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP1P32455 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP1P32455 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP1P32455 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP1P32455 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP1P32455 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP1P32455 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP1P32455 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP1P32455 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP1P32455 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP1P32455 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP1P32455 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP1P32455 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP1P32455 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP1P32455 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP1P32455 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP1P32455 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP1P32455 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP1P32455 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP1P32455 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP1P32455 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP1P32455 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP1P32455 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP1P32455 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP1P32455 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP1P32455 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP1P32455 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP1P32455 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP1P32455 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP1P32455 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP1P32455 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP1P32455 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP1P32455 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP1P32455 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms