Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms