Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRAP18433 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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