Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPN1P18031 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms