Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms