Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCF2P10911 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MCF2P10911 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MCF2P10911 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2P10911 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2P10911 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2P10911 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2P10911 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2P10911 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2P10911 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2P10911 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2P10911 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2P10911 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2P10911 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2P10911 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2P10911 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2P10911 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2P10911 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2P10911 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2P10911 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2P10911 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2P10911 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2P10911 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2P10911 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2P10911 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2P10911 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2P10911 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2P10911 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2P10911 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2P10911 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2P10911 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2P10911 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2P10911 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2P10911 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2P10911 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2P10911 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2P10911 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2P10911 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2P10911 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2P10911 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2P10911 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2P10911 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2P10911 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2P10911 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2P10911 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2P10911 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2P10911 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2P10911 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2P10911 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2P10911 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2P10911 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2P10911 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2P10911 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2P10911 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2P10911 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2P10911 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2P10911 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2P10911 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2P10911 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2P10911 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2P10911 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2P10911 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2P10911 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2P10911 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCF2P10911 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCF2P10911 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCF2P10911 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCF2P10911 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms