Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC172P0C7W6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms