Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERI3O43414 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERI3O43414 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERI3O43414 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERI3O43414 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERI3O43414 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERI3O43414 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERI3O43414 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERI3O43414 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERI3O43414 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERI3O43414 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERI3O43414 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERI3O43414 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERI3O43414 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERI3O43414 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERI3O43414 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERI3O43414 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ERI3O43414 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERI3O43414 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERI3O43414 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERI3O43414 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ERI3O43414 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ERI3O43414 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERI3O43414 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERI3O43414 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERI3O43414 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERI3O43414 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERI3O43414 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERI3O43414 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERI3O43414 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERI3O43414 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERI3O43414 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERI3O43414 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERI3O43414 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERI3O43414 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERI3O43414 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERI3O43414 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERI3O43414 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERI3O43414 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERI3O43414 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERI3O43414 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERI3O43414 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERI3O43414 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERI3O43414 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERI3O43414 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERI3O43414 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERI3O43414 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERI3O43414 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERI3O43414 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERI3O43414 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERI3O43414 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERI3O43414 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERI3O43414 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERI3O43414 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERI3O43414 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERI3O43414 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERI3O43414 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERI3O43414 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERI3O43414 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERI3O43414 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERI3O43414 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERI3O43414 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERI3O43414 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ERI3O43414 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERI3O43414 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERI3O43414 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERI3O43414 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERI3O43414 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERI3O43414 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERI3O43414 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERI3O43414 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERI3O43414 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERI3O43414 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERI3O43414 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERI3O43414 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERI3O43414 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERI3O43414 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERI3O43414 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERI3O43414 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERI3O43414 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERI3O43414 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERI3O43414 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERI3O43414 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERI3O43414 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERI3O43414 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ERI3O43414 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERI3O43414 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERI3O43414 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERI3O43414 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERI3O43414 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERI3O43414 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERI3O43414 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERI3O43414 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERI3O43414 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERI3O43414 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERI3O43414 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERI3O43414 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERI3O43414 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERI3O43414 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERI3O43414 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms