Protein–RNA interactions for Protein: A8MYZ0

MINDY4B, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4B, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY4BA8MYZ0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MINDY4BA8MYZ0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms