Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRIQ3A6PVS8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ3A6PVS8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms