Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q9Y3F1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms