Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms