Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBM28Q9NW13 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms