Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNCQ9H7C4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCQ9H7C4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms