Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOJQ9H4E5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOJQ9H4E5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOJQ9H4E5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOJQ9H4E5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOJQ9H4E5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RHOJQ9H4E5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOJQ9H4E5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms