Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms