Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms