Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRAIPQ9BWF2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAIPQ9BWF2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAIPQ9BWF2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAIPQ9BWF2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAIPQ9BWF2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAIPQ9BWF2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAIPQ9BWF2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAIPQ9BWF2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAIPQ9BWF2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms