Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLF1Q9BQI6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms