Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACCSQ96QU6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms