Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms