Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRIG1Q96JA1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms