Protein–RNA interactions for Protein: Q96J86

CYYR1, Cysteine and tyrosine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYYR1Q96J86 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CYYR1Q96J86 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms