Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD1Q96GM5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms