Protein–RNA interactions for Protein: Q96A49

SYAP1, Synapse-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYAP1Q96A49 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYAP1Q96A49 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYAP1Q96A49 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms