Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms