Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms