Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2M8

CLASRP, CLK4-associating serine/arginine rich protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASRPQ8N2M8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLASRPQ8N2M8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLASRPQ8N2M8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms