Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms