Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms