Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPRNQ4KMQ1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
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