Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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RPE65Q16518 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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RPE65Q16518 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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RPE65Q16518 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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RPE65Q16518 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPE65Q16518 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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RPE65Q16518 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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RPE65Q16518 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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RPE65Q16518 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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RPE65Q16518 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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RPE65Q16518 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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RPE65Q16518 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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