Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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