Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB3BPQ13352 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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