Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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