Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CHAF1AQ13111 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
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