Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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EFEMP1Q12805 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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EFEMP1Q12805 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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EFEMP1Q12805 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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EFEMP1Q12805 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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