Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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GTF3C1Q12789 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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GTF3C1Q12789 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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GTF3C1Q12789 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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GTF3C1Q12789 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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GTF3C1Q12789 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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GTF3C1Q12789 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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