Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms