Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms