Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIMK1P53667 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms