Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF6P49848 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF6P49848 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF6P49848 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF6P49848 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF6P49848 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF6P49848 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF6P49848 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF6P49848 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF6P49848 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF6P49848 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF6P49848 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF6P49848 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF6P49848 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF6P49848 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF6P49848 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF6P49848 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF6P49848 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF6P49848 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF6P49848 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF6P49848 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF6P49848 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF6P49848 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF6P49848 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF6P49848 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF6P49848 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF6P49848 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF6P49848 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF6P49848 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF6P49848 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF6P49848 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF6P49848 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF6P49848 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF6P49848 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF6P49848 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF6P49848 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF6P49848 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF6P49848 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF6P49848 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF6P49848 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF6P49848 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF6P49848 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF6P49848 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF6P49848 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF6P49848 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF6P49848 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF6P49848 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF6P49848 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF6P49848 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF6P49848 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TAF6P49848 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TAF6P49848 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF6P49848 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF6P49848 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF6P49848 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF6P49848 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF6P49848 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF6P49848 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF6P49848 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF6P49848 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF6P49848 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF6P49848 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF6P49848 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF6P49848 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF6P49848 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF6P49848 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF6P49848 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF6P49848 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF6P49848 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF6P49848 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF6P49848 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF6P49848 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF6P49848 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF6P49848 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF6P49848 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF6P49848 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF6P49848 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF6P49848 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF6P49848 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF6P49848 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF6P49848 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF6P49848 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF6P49848 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF6P49848 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF6P49848 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF6P49848 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF6P49848 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF6P49848 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF6P49848 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF6P49848 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF6P49848 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF6P49848 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF6P49848 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF6P49848 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF6P49848 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF6P49848 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF6P49848 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF6P49848 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF6P49848 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF6P49848 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms