Protein–RNA interactions for Protein: P43608

YFR035C, Uncharacterized protein YFR035C, yeastyeast

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YFR035CP43608 NEJ1YLR265C 1029 nt0.6□□□□□ -2.31
YFR035CP43608 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.6□□□□□ -2.31
YFR035CP43608 MUD2YKL074C 1584 nt0.6□□□□□ -2.31
YFR035CP43608 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt0.6□□□□□ -2.31
YFR035CP43608 NBL1YHR199C-A 222 nt0.59□□□□□ -2.31
YFR035CP43608 GRX8YLR364W 330 nt0.59□□□□□ -2.31
YFR035CP43608 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt0.59□□□□□ -2.31
YFR035CP43608 SFG1YOR315W 1041 nt0.59□□□□□ -2.31
YFR035CP43608 SEC1YDR164C 2175 nt0.58□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 SWI4YER111C 3282 nt0.58□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 NHP2YDL208W 471 nt0.58□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 SLU7YDR088C 1149 nt0.58□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 QCR9YGR183C 201 nt0.58□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 YAP3YHL009C 993 nt0.58□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 RPC25YKL144C 639 nt0.58□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 TIM18YOR297C 579 nt0.58□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt0.57□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 RTR1YER139C 681 nt0.57□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 SAY1YGR263C 1275 nt0.57□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt0.57□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 ISF1YMR081C 1017 nt0.57□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 RPS10BYMR230W 318 nt0.57□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 IRC23YOR044W 474 nt0.57□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 YBR062CYBR062C 543 nt0.57□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 STB6YKL072W 2301 nt0.56□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 YCR043CYCR043C 384 nt0.56□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.56□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 OST5YGL226C-A 261 nt0.56□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt0.56□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt0.56□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 YAL064WYAL064W 285 nt0.56□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.56□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.56□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 NUP157YER105C 4176 nt0.55□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 YDR262WYDR262W 819 nt0.55□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 TMA20YER007C-A 546 nt0.55□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 RPL16AYIL133C 600 nt0.55□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 HIT1YJR055W 495 nt0.55□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 YKL115CYKL115C 393 nt0.55□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 RPL40BYKR094C 387 nt0.55□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 CMC4YMR194C-B 222 nt0.55□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 YNL010WYNL010W 726 nt0.55□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 YNL179CYNL179C 438 nt0.55□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 IZH4YOL101C 939 nt0.55□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 YOL150CYOL150C 312 nt0.55□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 RRP15YPR143W 753 nt0.55□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 BIR1YJR089W 2865 nt0.55□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 SEC5YDR166C 2916 nt0.54□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 YDR521WYDR521W 336 nt0.54□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 MIC19YFR011C 513 nt0.54□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 PRM8YGL053W 714 nt0.54□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 YIR020CYIR020C 303 nt0.54□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 YJR071WYJR071W 369 nt0.54□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 ATP18YML081C-A 180 nt0.54□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 RIO2YNL207W 1278 nt0.54□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 ESA1YOR244W 1338 nt0.54□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 YLL054CYLL054C 2532 nt0.54□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 RSM28YDR494W 1086 nt0.53□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 VMA7YGR020C 357 nt0.53□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.53□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.53□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.53□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.53□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.53□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.53□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.53□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.53□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.53□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.53□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.53□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 URA10YMR271C 684 nt0.53□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 YNL171CYNL171C 369 nt0.53□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.53□□□□□ -2.32
YFR035CP43608 ABM1YJR108W 372 nt0.52□□□□□ -2.33
YFR035CP43608 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.52□□□□□ -2.33
YFR035CP43608 SWS2YNL081C 432 nt0.52□□□□□ -2.33
YFR035CP43608 YOL024WYOL024W 519 nt0.52□□□□□ -2.33
YFR035CP43608 YCK3YER123W 1575 nt0.52□□□□□ -2.33
YFR035CP43608 BI3Q0115 1554 nt0.52□□□□□ -2.33
YFR035CP43608 YCR016WYCR016W 873 nt0.51□□□□□ -2.33
YFR035CP43608 YDL009CYDL009C 324 nt0.51□□□□□ -2.33
YFR035CP43608 TSA2YDR453C 591 nt0.51□□□□□ -2.33
YFR035CP43608 MZM1YDR493W 372 nt0.51□□□□□ -2.33
YFR035CP43608 YGL217CYGL217C 342 nt0.51□□□□□ -2.33
YFR035CP43608 BTN2YGR142W 1233 nt0.51□□□□□ -2.33
YFR035CP43608 LAG1YHL003C 1236 nt0.51□□□□□ -2.33
YFR035CP43608 PPE1YHR075C 1203 nt0.51□□□□□ -2.33
YFR035CP43608 IST3YIR005W 447 nt0.51□□□□□ -2.33
YFR035CP43608 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt0.51□□□□□ -2.33
YFR035CP43608 RFA3YJL173C 369 nt0.51□□□□□ -2.33
YFR035CP43608 YLR031WYLR031W 561 nt0.51□□□□□ -2.33
YFR035CP43608 COX8YLR395C 237 nt0.51□□□□□ -2.33
YFR035CP43608 SPC24YMR117C 642 nt0.51□□□□□ -2.33
YFR035CP43608 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.51□□□□□ -2.33
YFR035CP43608 YOL014WYOL014W 375 nt0.51□□□□□ -2.33
YFR035CP43608 NDD1YOR372C 1665 nt0.51□□□□□ -2.33
YFR035CP43608 LSM4YER112W 564 nt0.5□□□□□ -2.33
YFR035CP43608 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.5□□□□□ -2.33
YFR035CP43608 URM1YIL008W 300 nt0.5□□□□□ -2.33
YFR035CP43608 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt0.5□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.9 ms