Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NR4A2P43354 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR4A2P43354 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms