Protein–RNA interactions for Protein: P40005

GIM4, Prefoldin subunit 2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GIM4P40005 YCR043CYCR043C 384 nt0.73□□□□□ -2.29
GIM4P40005 YBR062CYBR062C 543 nt0.73□□□□□ -2.29
GIM4P40005 CDC39YCR093W 6327 nt0.73□□□□□ -2.29
GIM4P40005 YDR262WYDR262W 819 nt0.72□□□□□ -2.29
GIM4P40005 MIC19YFR011C 513 nt0.72□□□□□ -2.29
GIM4P40005 YAP3YHL009C 993 nt0.72□□□□□ -2.29
GIM4P40005 NBL1YHR199C-A 222 nt0.72□□□□□ -2.29
GIM4P40005 ABM1YJR108W 372 nt0.72□□□□□ -2.29
GIM4P40005 YNL179CYNL179C 438 nt0.72□□□□□ -2.29
GIM4P40005 YOL150CYOL150C 312 nt0.72□□□□□ -2.29
GIM4P40005 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.72□□□□□ -2.29
GIM4P40005 NUP157YER105C 4176 nt0.71□□□□□ -2.3
GIM4P40005 YJR003CYJR003C 1560 nt0.71□□□□□ -2.3
GIM4P40005 NHP2YDL208W 471 nt0.71□□□□□ -2.3
GIM4P40005 TSA2YDR453C 591 nt0.71□□□□□ -2.3
GIM4P40005 YDR521WYDR521W 336 nt0.71□□□□□ -2.3
GIM4P40005 RPC25YKL144C 639 nt0.71□□□□□ -2.3
GIM4P40005 CMC4YMR194C-B 222 nt0.71□□□□□ -2.3
GIM4P40005 SEC1YDR164C 2175 nt0.71□□□□□ -2.3
GIM4P40005 PRP16YKR086W 3216 nt0.7□□□□□ -2.3
GIM4P40005 SEC5YDR166C 2916 nt0.7□□□□□ -2.3
GIM4P40005 RPL16AYIL133C 600 nt0.7□□□□□ -2.3
GIM4P40005 RFA3YJL173C 369 nt0.7□□□□□ -2.3
GIM4P40005 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.7□□□□□ -2.3
GIM4P40005 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt0.7□□□□□ -2.3
GIM4P40005 NDD1YOR372C 1665 nt0.69□□□□□ -2.3
GIM4P40005 COX8YLR395C 237 nt0.69□□□□□ -2.3
GIM4P40005 YBL083CYBL083C 426 nt0.69□□□□□ -2.3
GIM4P40005 YMR160WYMR160W 2451 nt0.69□□□□□ -2.3
GIM4P40005 YCR016WYCR016W 873 nt0.68□□□□□ -2.3
GIM4P40005 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.68□□□□□ -2.3
GIM4P40005 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt0.68□□□□□ -2.3
GIM4P40005 PPE1YHR075C 1203 nt0.68□□□□□ -2.3
GIM4P40005 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.68□□□□□ -2.3
GIM4P40005 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.68□□□□□ -2.3
GIM4P40005 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.68□□□□□ -2.3
GIM4P40005 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.68□□□□□ -2.3
GIM4P40005 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.68□□□□□ -2.3
GIM4P40005 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.68□□□□□ -2.3
GIM4P40005 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.68□□□□□ -2.3
GIM4P40005 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.68□□□□□ -2.3
GIM4P40005 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.68□□□□□ -2.3
GIM4P40005 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.68□□□□□ -2.3
GIM4P40005 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.68□□□□□ -2.3
GIM4P40005 YIR020CYIR020C 303 nt0.68□□□□□ -2.3
GIM4P40005 YJR071WYJR071W 369 nt0.68□□□□□ -2.3
GIM4P40005 URA10YMR271C 684 nt0.68□□□□□ -2.3
GIM4P40005 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.68□□□□□ -2.3
GIM4P40005 YDL073WYDL073W 2955 nt0.68□□□□□ -2.3
GIM4P40005 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.67□□□□□ -2.3
GIM4P40005 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.67□□□□□ -2.3
GIM4P40005 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.67□□□□□ -2.3
GIM4P40005 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.67□□□□□ -2.3
GIM4P40005 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.67□□□□□ -2.3
GIM4P40005 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.67□□□□□ -2.3
GIM4P40005 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.67□□□□□ -2.3
GIM4P40005 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.67□□□□□ -2.3
GIM4P40005 YGL217CYGL217C 342 nt0.67□□□□□ -2.3
GIM4P40005 YNL171CYNL171C 369 nt0.67□□□□□ -2.3
GIM4P40005 RRP15YPR143W 753 nt0.67□□□□□ -2.3
GIM4P40005 NOT5YPR072W 1683 nt0.66□□□□□ -2.3
GIM4P40005 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt0.66□□□□□ -2.3
GIM4P40005 VMA7YGR020C 357 nt0.66□□□□□ -2.3
GIM4P40005 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt0.66□□□□□ -2.3
GIM4P40005 YNL010WYNL010W 726 nt0.66□□□□□ -2.3
GIM4P40005 SLX4YLR135W 2247 nt0.65□□□□□ -2.3
GIM4P40005 SLU7YDR088C 1149 nt0.65□□□□□ -2.31
GIM4P40005 MZM1YDR493W 372 nt0.65□□□□□ -2.31
GIM4P40005 SAY1YGR263C 1275 nt0.65□□□□□ -2.31
GIM4P40005 HYM1YKL189W 1200 nt0.65□□□□□ -2.31
GIM4P40005 YLR031WYLR031W 561 nt0.65□□□□□ -2.31
GIM4P40005 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.65□□□□□ -2.31
GIM4P40005 YBR051WYBR051W 351 nt0.65□□□□□ -2.31
GIM4P40005 UTP20YBL004W 7482 nt0.65□□□□□ -2.31
GIM4P40005 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.64□□□□□ -2.31
GIM4P40005 IST3YIR005W 447 nt0.64□□□□□ -2.31
GIM4P40005 HIT1YJR055W 495 nt0.64□□□□□ -2.31
GIM4P40005 SMD2YLR275W 333 nt0.64□□□□□ -2.31
GIM4P40005 YOL024WYOL024W 519 nt0.64□□□□□ -2.31
GIM4P40005 APL3YBL037W 3078 nt0.64□□□□□ -2.31
GIM4P40005 RKR1YMR247C 4689 nt0.63□□□□□ -2.31
GIM4P40005 RSM28YDR494W 1086 nt0.63□□□□□ -2.31
GIM4P40005 SWS2YNL081C 432 nt0.63□□□□□ -2.31
GIM4P40005 IZH4YOL101C 939 nt0.63□□□□□ -2.31
GIM4P40005 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.63□□□□□ -2.31
GIM4P40005 YLL054CYLL054C 2532 nt0.63□□□□□ -2.31
GIM4P40005 OSH6YKR003W 1347 nt0.63□□□□□ -2.31
GIM4P40005 ESA1YOR244W 1338 nt0.63□□□□□ -2.31
GIM4P40005 BI3Q0115 1554 nt0.62□□□□□ -2.31
GIM4P40005 BRO1YPL084W 2535 nt0.62□□□□□ -2.31
GIM4P40005 LSM4YER112W 564 nt0.62□□□□□ -2.31
GIM4P40005 BTN2YGR142W 1233 nt0.62□□□□□ -2.31
GIM4P40005 PHS1YJL097W 654 nt0.62□□□□□ -2.31
GIM4P40005 BRX1YOL077C 876 nt0.62□□□□□ -2.31
GIM4P40005 PEX34YCL056C 435 nt0.62□□□□□ -2.31
GIM4P40005 AIM9YER080W 1884 nt0.61□□□□□ -2.31
GIM4P40005 YDL009CYDL009C 324 nt0.61□□□□□ -2.31
GIM4P40005 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.61□□□□□ -2.31
GIM4P40005 PRM8YGL053W 714 nt0.61□□□□□ -2.31
GIM4P40005 LAG1YHL003C 1236 nt0.61□□□□□ -2.31
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